导致阴茎颜色深（即“很黑”）的原因有很多，例如遗传因素、年龄因素、激素因素、摩擦因素、炎症因素等。
1、遗传因素：人们的肤色由遗传基因决定，因此有些人是先天性的肤色和（或）生殖器颜色较深。
2、年龄因素：随着年龄增长，可能会出现色素沉着，进而引起阴茎及全身各处皮肤出现颜色变深的情况。
3、激素因素：由于激素水平变化，可能会影响阴茎区域的黑色素的产生，进而引起阴茎及周围区域颜色加深。
4、摩擦因素：经常穿着过紧的裤子、长期行走或活动、性生活频繁等，都会导致阴茎皮肤摩擦增多，从而引起色素沉着，致使局部颜色加深。
5、炎症因素：局部皮肤黏膜发生过敏、病原体感染、性病等原因所致的炎症反应，也可导致色素沉着的发生，进而导致病变部位颜色加深。
综上所述，阴茎颜色偏深可能是正常生理变化，也可能是由病理因素所导致。因此，发现阴茎颜色偏深时，无需过度恐慌。如果同时伴有皮疹、瘙痒、分泌物增多、排尿困难、性功能障碍者，应及时到正规医院的男科、泌尿外科就诊，由专科医生明确诊断，并开展专科治疗。患者不宜自我判断或自行用药，以免因治疗不当而导致病情加重或延误。